Najvyšší súd však rozsudok zrušil a nariadil dokazovanie rozšíriť. Nový rozsudok predseda senátu oprel o daktyloskopické stopy, ktoré obžalovaný nechal na pohári v byte zavraždeného nemeckého mladíka v septembri 1991. Medzi dôkazmi proti obžalovanému boli i výsledky analýz DNA vykonané slovenskými i nemeckými justičnými orgánmi a výpoveď priateľky zavraždeného, ktorá ich vraj v ten deň videla spolu. Proti obžalovanému bola i analýza troch cigaretových ohorkov, pri ktorej sa na jednom našla stopa nevylučujúca Jána M. ako možného páchateľa.
Obžalovaný nepoprel svoj pobyt v Berlíne, kde si v tom čase hľadal prácu. Mal prespávať v rôznych bytoch v spoločnosti viacerých mužov i žien. Nepozná ani priateľku zavraždeného Nemca a opakovane odmietol tvrdenie, že vraždil. Podľa Jána M. vyšetrovanie bolo zmanipulované a pohár s jeho odtlačkami musel do bytu zavraždeného priniesť niekto cudzí.
Priateľka zavraždeného Larsa na hlavné pojednávanie neprišla zo zdravotných dôvodov. Pri výsluchu v Nemecku na predložených fotografiách Jána M. jednoznačne poznala. Nakreslila i tzv. fantómový obraz, ktorý doniesla na súd matka zavraždeného. Matka zavraždeného mladíka Annegret Sabew požadovala spravodlivý trest. Pre TASR uviedla, že s rozsudkom je spokojná v porovnaní s predchádzajúcim verdiktom, keď bol obžalovaný oslobodený.
Ján M. je v súčasnosti vo väzení. Od decembra si za viaceré vlámania odpykáva päťročné väzenie. Predtým bol súdne trestaný sedemkrát.